其中，类似于外朝吏部职能的就是和珅担任的总管内务府大臣，掌管着内务府所有官员的官制、官缺、升调补放、功过赏罚等。类似于户部职能的是广储司和会计司。前者统筹内廷所需的物资出纳，设立银、皮、瓷、缎、衣、茶六库，铜、银、染、衣、绣、花、皮七匠作，江宁、苏州、杭州三织造衙门；后者统领畿辅、盛京、锦州、热河、归化城、打牲乌拉、驻马口外等地庄园共886处，按等课其赋税和编审庄丁，此外会计司还具有选送太监、宫女、乳母、保姥之责任。

类似于礼部的是掌仪司，它掌管内廷礼乐之事，诸如珅宁宫献神祈福、皇帝拜天、祭祀堂子、祭祀清宁宫、祭祀奉先殿、供奉皇寿殿、丰泽园演耕藉礼、皇后礼先蚕以及内廷朝贺、筵宴、皇子公主嫁娶礼仪、考核太监都属掌仪司的职权范围，此外还兼办畿辅、盛京等处果园赋银，兼管萨满神房和奏乐演戏的升平署。

类似于兵部的是都虞司，内务府武装主要用来禁卫内廷、行宫、陵寝，扈从皇帝车驾，引导皇后、妃嫔、王子、公主出入。其成员均选自上三旗，组成亲军营，还有一、二、三等侍卫、蓝翎侍卫、拜唐阿等职。另外，上驷院和庆丰司所辖牧场官弁的选授、升级等事，亦都归于都虞司。都虞司在松花江设打牲乌拉，编其丁为“珠轩”，专门缴纳东珠、松子、蜂蜜、鱼类等；在近京的口外又有鹰户、枪手户、鹅户、猎户、蜜户、海龙户、狐皮户、网手户、细鳞鱼户，每年亦各征收“畋渔之物以准赋”。

类似于刑部的是慎刑司，宫女、太监和大内匠役犯罪，比照刑律轻重定科，也归在它的名下。不过，慎刑司的权力一般只限于很轻的罪过，徒刑以上就要移咨刑部，罪须经三法司会审。在内务府，还设有“掌缉捕之事”的管辖番役处，那是负责查捕府属三旗逃犯和逃亡太监的。

类似于工部的是营造司，掌管禁地修缮。其他如皇帝出巡清“御道”、后妃出入陈“步障”，都由该司或会同工部进行。营造司下设木、铁、房、器、薪、炭六库和铁、漆、爆三作，以保证工程的需要。

除上述以外，内务府下还设有庆丰司，负责牛羊畜牧事务，供宫廷祭祀、礼仪、食用所需，它在京城和口外、盛京、吉林等地都设有场。

上驷院专供皇帝并宫廷乘骑、车用马匹，禁城中有内厩，南苑有外厩，又置盛京大凌河、商都达布逊诺尔、达里冈爱等牧场。

武备院备办御用甲胄、弓矢、兵仗、鞍、辔、行帐。设北案库，辖案板作和细房、账房库；南案库辖熟皮作；甲库辖胄作、穿甲作；毡库辖备弓处、备箭处、能头作、靴皮作、毡作、帽作、杂活作。

奉宸院是管理皇家园苑的机构，具体包括景山、西苑、倚虹堂（紫竹院）、养源斋（钓鱼台）、天坛斋宫、南苑、丰泽园（中海）等地。至于西郊的三山五园以及热河避暑山庄、汤泉、盘山、黄新庄等处行宫，则另派大臣管理。

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